Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK4Q16099 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms