Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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