Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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