Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms