Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1D2Q14995 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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NR1D2Q14995 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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NR1D2Q14995 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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NR1D2Q14995 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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NR1D2Q14995 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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NR1D2Q14995 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1D2Q14995 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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