Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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