Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
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