Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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SHROOM2Q13796 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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SHROOM2Q13796 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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SHROOM2Q13796 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
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SHROOM2Q13796 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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SHROOM2Q13796 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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SHROOM2Q13796 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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