Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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