Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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IRF5Q13568 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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IRF5Q13568 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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IRF5Q13568 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF5Q13568 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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