Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TUBB3Q13509 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TUBB3Q13509 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBB3Q13509 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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