Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms