Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCOF1Q13428 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCOF1Q13428 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms