Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ITGB3BPQ13352 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ITGB3BPQ13352 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ITGB3BPQ13352 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB3BPQ13352 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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