Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms