Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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