Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RESTQ13127 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RESTQ13127 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RESTQ13127 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RESTQ13127 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RESTQ13127 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RESTQ13127 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RESTQ13127 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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RESTQ13127 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RESTQ13127 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RESTQ13127 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RESTQ13127 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RESTQ13127 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RESTQ13127 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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