Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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