Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSPB3Q12988 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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