Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms