Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXO1Q12778 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXO1Q12778 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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