Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms