Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSRP1Q08945 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms