Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPAQ06546 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms