Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms