Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms