Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms