Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDC42EP1Q00587 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDC42EP1Q00587 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms