Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMF1P82094 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms