Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms