Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP107P57740 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP107P57740 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP107P57740 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP107P57740 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP107P57740 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP107P57740 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP107P57740 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms