Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3P57055 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3P57055 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms