Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TPTEP56180 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPTEP56180 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms