Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORCP51449 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORCP51449 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RORCP51449 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms