Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA4P43681 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms