Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms