Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAPGP40121 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAPGP40121 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAPGP40121 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms