Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms