Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPARGP37231 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms