Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPC1P35052 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms