Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC1P33527 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms