Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms