Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms