Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX1P27695 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APEX1P27695 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX1P27695 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX1P27695 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX1P27695 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX1P27695 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX1P27695 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms