Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VARSP26640 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VARSP26640 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VARSP26640 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VARSP26640 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms