Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APCP25054 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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APCP25054 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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APCP25054 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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APCP25054 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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APCP25054 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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APCP25054 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APCP25054 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APCP25054 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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