Protein–RNA interactions for Protein: P23528

CFL1, Cofilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFL1P23528 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFL1P23528 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFL1P23528 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFL1P23528 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFL1P23528 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFL1P23528 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFL1P23528 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFL1P23528 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFL1P23528 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms