Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF4P23510 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms