Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms