Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EPHA1P21709 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms